DEBEcoMod

Growth, performance & reproduction

DEBEcoMod è un innovativo strumento open-source sviluppato dal Laboratorio di Ecologia dell’Università di Palermo. Basato sulla teoria del Dynamic Energy Budget (DEB), DEBEcoMod consente di effettuare previsioni sui Life-History traits degli organismi marini, quali ad esempio la lunghezza massima, il peso, il numero di uova emesse etc., tenendo conto di variabili ambientali e stressor antropogenici.

Questo tool supera le limitazioni computazionali riscontrati in altri casi, permettendo analisi dettagliate su ampie scale spaziali e temporali. DEBEcoMod trova applicazione in numerosi contesti, tra cui la marine spatial planning, l'acquacoltura integrata multitrofica e la gestione degli ecosistemi marini.

Funzionamento

DEBEcoMod è stato sviluppato in linguaggio R e utilizza direttamente i parametri dell’AddMyPet collection per simulare le performance degli organismi modello. Gli utenti possono personalizzare le simulazioni inserendo dati ambientali specifici, come la temperatura superficiale del mare e la disponibilità di cibo.

Tra le funzionalità principali:

  • Previsioni biologiche: crescita, maturazione, riproduzione e sopravvivenza degli organismi;
  • Rappresentazioni spaziali: mappe intuitive che facilitano l’interpretazione dei risultati per stakeholder e ricercatori;
  • Applicazioni diversificate: valutazione delle performance di crescita in ambiti di acquacoltura, gestione delle specie invasive e impatto dei cambiamenti climatici.

Il codice è ottimizzato per simulazioni su larga scala, garantendo al contempo precisione e accessibilità.

Link alla Pubblicazione

Scopri di più su DEBEcoMod e sulle sue possibili applicazioni leggendo il lavoro scientifico pubblicato su Ecological Informatics con cui è stato presentato: DOI: 10.1016/j.ecoinf.2024.102897

Scarica il Tool

DEBEcoMod è disponibile gratuitamente su GitHub con licenza GPL-3.0. Ti invitiamo a esplorare, personalizzare e contribuire a questo strumento per migliorare la gestione e la conservazione degli ecosistemi marini.

Di seguito una lista delle specie parametrizzate dal Laboratorio di Ecologia, i cui parametri sono disponibili sull’AddMyPet collection:
Nome scientifico Nome comune Autore/i
Aphanius fasciatus Mediterranean killfish Sarà G.
Brachidontes pharaoni Rayed erythrean mussel Sarà G.
Chromis chromis Damselfish Giacoletti, A.; Sarà G.
Eriphia verrucosa Warty crab Giacoletti, A.; Sarà G.
Mytilaster minimus Dwarf mussel Sarà G.
Mytilopsis sallei Black-striped mussel Giacoletti, A.; Sarà G.
Mytilus californianus California mussel Sarà G.
Mytilus galloprovincialis Mediterranean mussel Sarà G.
Perna canalicolus New Zealand green-lipped mussel Giacoletti, A.; Sarà G.
Perna perna Brown mussel Sarà G.
Septifer virgatus Purple peacock clam Sarà G.